Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

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Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnaseh2cQ9CQ18 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnaseh2cQ9CQ18 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnaseh2cQ9CQ18 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnaseh2cQ9CQ18 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnaseh2cQ9CQ18 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnaseh2cQ9CQ18 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnaseh2cQ9CQ18 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnaseh2cQ9CQ18 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnaseh2cQ9CQ18 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnaseh2cQ9CQ18 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnaseh2cQ9CQ18 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnaseh2cQ9CQ18 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnaseh2cQ9CQ18 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnaseh2cQ9CQ18 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnaseh2cQ9CQ18 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnaseh2cQ9CQ18 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnaseh2cQ9CQ18 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnaseh2cQ9CQ18 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnaseh2cQ9CQ18 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnaseh2cQ9CQ18 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnaseh2cQ9CQ18 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnaseh2cQ9CQ18 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Rnaseh2cQ9CQ18 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnaseh2cQ9CQ18 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnaseh2cQ9CQ18 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnaseh2cQ9CQ18 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnaseh2cQ9CQ18 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnaseh2cQ9CQ18 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnaseh2cQ9CQ18 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnaseh2cQ9CQ18 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnaseh2cQ9CQ18 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnaseh2cQ9CQ18 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnaseh2cQ9CQ18 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnaseh2cQ9CQ18 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnaseh2cQ9CQ18 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnaseh2cQ9CQ18 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnaseh2cQ9CQ18 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnaseh2cQ9CQ18 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Rnaseh2cQ9CQ18 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnaseh2cQ9CQ18 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnaseh2cQ9CQ18 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Rnaseh2cQ9CQ18 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnaseh2cQ9CQ18 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Rnaseh2cQ9CQ18 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Rnaseh2cQ9CQ18 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Rnaseh2cQ9CQ18 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnaseh2cQ9CQ18 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnaseh2cQ9CQ18 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnaseh2cQ9CQ18 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnaseh2cQ9CQ18 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnaseh2cQ9CQ18 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnaseh2cQ9CQ18 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnaseh2cQ9CQ18 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnaseh2cQ9CQ18 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnaseh2cQ9CQ18 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnaseh2cQ9CQ18 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnaseh2cQ9CQ18 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnaseh2cQ9CQ18 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnaseh2cQ9CQ18 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rnaseh2cQ9CQ18 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnaseh2cQ9CQ18 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnaseh2cQ9CQ18 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnaseh2cQ9CQ18 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnaseh2cQ9CQ18 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnaseh2cQ9CQ18 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnaseh2cQ9CQ18 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnaseh2cQ9CQ18 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms