Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Chmp3Q9CQ10 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms