Protein–RNA interactions for Protein: Q99N07

Ms4a6d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6D, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6dQ99N07 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ms4a6dQ99N07 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ms4a6dQ99N07 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ms4a6dQ99N07 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ms4a6dQ99N07 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ms4a6dQ99N07 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ms4a6dQ99N07 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ms4a6dQ99N07 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ms4a6dQ99N07 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ms4a6dQ99N07 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ms4a6dQ99N07 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ms4a6dQ99N07 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ms4a6dQ99N07 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ms4a6dQ99N07 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ms4a6dQ99N07 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ms4a6dQ99N07 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a6dQ99N07 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a6dQ99N07 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a6dQ99N07 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a6dQ99N07 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a6dQ99N07 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a6dQ99N07 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a6dQ99N07 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a6dQ99N07 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a6dQ99N07 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a6dQ99N07 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a6dQ99N07 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a6dQ99N07 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a6dQ99N07 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a6dQ99N07 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a6dQ99N07 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a6dQ99N07 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a6dQ99N07 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a6dQ99N07 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a6dQ99N07 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a6dQ99N07 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a6dQ99N07 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a6dQ99N07 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a6dQ99N07 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a6dQ99N07 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a6dQ99N07 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a6dQ99N07 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a6dQ99N07 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a6dQ99N07 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a6dQ99N07 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a6dQ99N07 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a6dQ99N07 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a6dQ99N07 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a6dQ99N07 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a6dQ99N07 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a6dQ99N07 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Ms4a6dQ99N07 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ms4a6dQ99N07 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a6dQ99N07 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Ms4a6dQ99N07 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Ms4a6dQ99N07 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Ms4a6dQ99N07 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC11□□□□□ -0.65
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Ms4a6dQ99N07 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a6dQ99N07 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a6dQ99N07 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a6dQ99N07 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a6dQ99N07 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a6dQ99N07 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a6dQ99N07 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a6dQ99N07 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a6dQ99N07 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a6dQ99N07 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a6dQ99N07 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a6dQ99N07 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a6dQ99N07 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a6dQ99N07 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a6dQ99N07 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a6dQ99N07 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ms4a6dQ99N07 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
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Ms4a6dQ99N07 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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