Protein–RNA interactions for Protein: Q99K23

Ufsp2, Ufm1-specific protease 2, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufsp2Q99K23 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ufsp2Q99K23 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ufsp2Q99K23 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ufsp2Q99K23 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ufsp2Q99K23 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ufsp2Q99K23 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ufsp2Q99K23 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ufsp2Q99K23 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ufsp2Q99K23 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ufsp2Q99K23 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ufsp2Q99K23 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ufsp2Q99K23 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ufsp2Q99K23 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ufsp2Q99K23 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ufsp2Q99K23 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ufsp2Q99K23 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ufsp2Q99K23 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ufsp2Q99K23 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ufsp2Q99K23 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ufsp2Q99K23 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ufsp2Q99K23 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ufsp2Q99K23 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ufsp2Q99K23 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ufsp2Q99K23 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ufsp2Q99K23 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ufsp2Q99K23 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ufsp2Q99K23 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ufsp2Q99K23 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ufsp2Q99K23 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ufsp2Q99K23 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ufsp2Q99K23 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ufsp2Q99K23 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ufsp2Q99K23 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ufsp2Q99K23 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ufsp2Q99K23 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ufsp2Q99K23 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ufsp2Q99K23 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ufsp2Q99K23 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ufsp2Q99K23 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ufsp2Q99K23 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ufsp2Q99K23 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ufsp2Q99K23 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ufsp2Q99K23 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ufsp2Q99K23 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ufsp2Q99K23 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ufsp2Q99K23 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ufsp2Q99K23 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ufsp2Q99K23 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ufsp2Q99K23 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ufsp2Q99K23 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ufsp2Q99K23 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ufsp2Q99K23 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ufsp2Q99K23 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ufsp2Q99K23 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ufsp2Q99K23 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ufsp2Q99K23 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ufsp2Q99K23 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ufsp2Q99K23 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ufsp2Q99K23 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ufsp2Q99K23 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ufsp2Q99K23 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ufsp2Q99K23 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ufsp2Q99K23 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ufsp2Q99K23 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ufsp2Q99K23 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ufsp2Q99K23 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ufsp2Q99K23 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ufsp2Q99K23 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ufsp2Q99K23 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ufsp2Q99K23 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ufsp2Q99K23 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ufsp2Q99K23 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ufsp2Q99K23 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ufsp2Q99K23 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ufsp2Q99K23 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ufsp2Q99K23 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ufsp2Q99K23 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ufsp2Q99K23 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ufsp2Q99K23 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ufsp2Q99K23 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ufsp2Q99K23 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ufsp2Q99K23 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ufsp2Q99K23 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ufsp2Q99K23 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ufsp2Q99K23 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ufsp2Q99K23 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ufsp2Q99K23 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ufsp2Q99K23 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ufsp2Q99K23 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ufsp2Q99K23 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ufsp2Q99K23 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ufsp2Q99K23 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ufsp2Q99K23 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ufsp2Q99K23 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ufsp2Q99K23 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ufsp2Q99K23 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ufsp2Q99K23 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ufsp2Q99K23 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ufsp2Q99K23 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ufsp2Q99K23 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms