Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ddb2Q99J79 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ddb2Q99J79 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ddb2Q99J79 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ddb2Q99J79 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ddb2Q99J79 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ddb2Q99J79 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ddb2Q99J79 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ddb2Q99J79 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ddb2Q99J79 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Ddb2Q99J79 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Ddb2Q99J79 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Ddb2Q99J79 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Ddb2Q99J79 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ddb2Q99J79 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Ddb2Q99J79 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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