Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
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Apobec3Q99J72 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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