Protein–RNA interactions for Protein: Q925I7

Pdgfd, Platelet-derived growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfdQ925I7 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PdgfdQ925I7 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PdgfdQ925I7 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfdQ925I7 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfdQ925I7 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfdQ925I7 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfdQ925I7 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfdQ925I7 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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PdgfdQ925I7 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfdQ925I7 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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PdgfdQ925I7 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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PdgfdQ925I7 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfdQ925I7 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfdQ925I7 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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PdgfdQ925I7 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfdQ925I7 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PdgfdQ925I7 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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PdgfdQ925I7 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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PdgfdQ925I7 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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PdgfdQ925I7 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfdQ925I7 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfdQ925I7 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PdgfdQ925I7 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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PdgfdQ925I7 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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PdgfdQ925I7 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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PdgfdQ925I7 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfdQ925I7 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfdQ925I7 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfdQ925I7 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfdQ925I7 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
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PdgfdQ925I7 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PdgfdQ925I7 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC15.08■□□□□ 0
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