Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tubb6Q922F4 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms