Protein–RNA interactions for Protein: Q920F6

Smc1b, Structural maintenance of chromosomes protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc1bQ920F6 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smc1bQ920F6 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms