Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS8

Stx18, Syntaxin-18, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx18Q8VDS8 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Stx18Q8VDS8 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Stx18Q8VDS8 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Stx18Q8VDS8 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Stx18Q8VDS8 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Stx18Q8VDS8 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Stx18Q8VDS8 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Stx18Q8VDS8 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Stx18Q8VDS8 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Stx18Q8VDS8 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Stx18Q8VDS8 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Stx18Q8VDS8 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Stx18Q8VDS8 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Stx18Q8VDS8 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Stx18Q8VDS8 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Stx18Q8VDS8 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Stx18Q8VDS8 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Stx18Q8VDS8 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Stx18Q8VDS8 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Stx18Q8VDS8 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Stx18Q8VDS8 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Stx18Q8VDS8 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Stx18Q8VDS8 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Stx18Q8VDS8 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Stx18Q8VDS8 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Stx18Q8VDS8 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Stx18Q8VDS8 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Stx18Q8VDS8 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Stx18Q8VDS8 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Stx18Q8VDS8 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Stx18Q8VDS8 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Stx18Q8VDS8 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Stx18Q8VDS8 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Stx18Q8VDS8 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Stx18Q8VDS8 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Stx18Q8VDS8 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Stx18Q8VDS8 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Stx18Q8VDS8 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Stx18Q8VDS8 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Stx18Q8VDS8 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Stx18Q8VDS8 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Stx18Q8VDS8 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Stx18Q8VDS8 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Stx18Q8VDS8 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Stx18Q8VDS8 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Stx18Q8VDS8 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Stx18Q8VDS8 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Stx18Q8VDS8 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Stx18Q8VDS8 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Stx18Q8VDS8 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Stx18Q8VDS8 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Stx18Q8VDS8 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Stx18Q8VDS8 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Stx18Q8VDS8 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Stx18Q8VDS8 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Stx18Q8VDS8 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Stx18Q8VDS8 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Stx18Q8VDS8 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Stx18Q8VDS8 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Stx18Q8VDS8 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Stx18Q8VDS8 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Stx18Q8VDS8 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Stx18Q8VDS8 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Stx18Q8VDS8 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Stx18Q8VDS8 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Stx18Q8VDS8 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Stx18Q8VDS8 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Stx18Q8VDS8 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Stx18Q8VDS8 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Stx18Q8VDS8 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Stx18Q8VDS8 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Stx18Q8VDS8 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Stx18Q8VDS8 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Stx18Q8VDS8 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Stx18Q8VDS8 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Stx18Q8VDS8 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Stx18Q8VDS8 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Stx18Q8VDS8 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Stx18Q8VDS8 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Stx18Q8VDS8 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Stx18Q8VDS8 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Stx18Q8VDS8 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Stx18Q8VDS8 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Stx18Q8VDS8 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Stx18Q8VDS8 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Stx18Q8VDS8 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Stx18Q8VDS8 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Stx18Q8VDS8 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Stx18Q8VDS8 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Stx18Q8VDS8 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Stx18Q8VDS8 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Stx18Q8VDS8 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Stx18Q8VDS8 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Stx18Q8VDS8 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Stx18Q8VDS8 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Stx18Q8VDS8 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Stx18Q8VDS8 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms