Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS4

Rprd1a, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1aQ8VDS4 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rprd1aQ8VDS4 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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