Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCG9

Rfxap, Regulatory factor X-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfxapQ8VCG9 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RfxapQ8VCG9 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
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