Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Q8

Colec12, Collectin-12, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec12Q8K4Q8 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Colec12Q8K4Q8 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Colec12Q8K4Q8 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Colec12Q8K4Q8 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Colec12Q8K4Q8 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Colec12Q8K4Q8 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Colec12Q8K4Q8 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Colec12Q8K4Q8 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Colec12Q8K4Q8 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Colec12Q8K4Q8 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Colec12Q8K4Q8 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Colec12Q8K4Q8 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Colec12Q8K4Q8 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Colec12Q8K4Q8 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Colec12Q8K4Q8 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Colec12Q8K4Q8 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Colec12Q8K4Q8 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Colec12Q8K4Q8 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Colec12Q8K4Q8 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Colec12Q8K4Q8 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Colec12Q8K4Q8 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Colec12Q8K4Q8 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Colec12Q8K4Q8 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Colec12Q8K4Q8 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Colec12Q8K4Q8 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Colec12Q8K4Q8 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Colec12Q8K4Q8 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Colec12Q8K4Q8 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Colec12Q8K4Q8 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Colec12Q8K4Q8 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Colec12Q8K4Q8 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Colec12Q8K4Q8 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Colec12Q8K4Q8 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Colec12Q8K4Q8 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Colec12Q8K4Q8 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Colec12Q8K4Q8 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Colec12Q8K4Q8 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Colec12Q8K4Q8 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Colec12Q8K4Q8 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Colec12Q8K4Q8 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Colec12Q8K4Q8 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Colec12Q8K4Q8 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Colec12Q8K4Q8 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Colec12Q8K4Q8 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Colec12Q8K4Q8 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Colec12Q8K4Q8 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Colec12Q8K4Q8 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Colec12Q8K4Q8 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Colec12Q8K4Q8 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Colec12Q8K4Q8 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Colec12Q8K4Q8 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Colec12Q8K4Q8 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Colec12Q8K4Q8 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Colec12Q8K4Q8 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Colec12Q8K4Q8 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Colec12Q8K4Q8 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Colec12Q8K4Q8 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Colec12Q8K4Q8 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Colec12Q8K4Q8 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Colec12Q8K4Q8 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Colec12Q8K4Q8 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Colec12Q8K4Q8 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Colec12Q8K4Q8 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Colec12Q8K4Q8 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Colec12Q8K4Q8 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Colec12Q8K4Q8 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Colec12Q8K4Q8 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Colec12Q8K4Q8 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Colec12Q8K4Q8 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Colec12Q8K4Q8 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Colec12Q8K4Q8 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Colec12Q8K4Q8 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Colec12Q8K4Q8 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Colec12Q8K4Q8 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Colec12Q8K4Q8 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Colec12Q8K4Q8 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Colec12Q8K4Q8 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Colec12Q8K4Q8 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Colec12Q8K4Q8 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Colec12Q8K4Q8 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Colec12Q8K4Q8 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Colec12Q8K4Q8 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Colec12Q8K4Q8 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Colec12Q8K4Q8 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Colec12Q8K4Q8 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Colec12Q8K4Q8 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Colec12Q8K4Q8 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Colec12Q8K4Q8 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Colec12Q8K4Q8 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Colec12Q8K4Q8 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms