Protein–RNA interactions for Protein: Q8K411

Pitrm1, Presequence protease, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitrm1Q8K411 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pitrm1Q8K411 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms