Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Lrrtm1Q8K377 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Lrrtm1Q8K377 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms