Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F3

Depp1, Protein DEPP1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depp1Q8K2F3 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Depp1Q8K2F3 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms