Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Cldn34c1Q8K193 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Cldn34c1Q8K193 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Cldn34c1Q8K193 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Cldn34c1Q8K193 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
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