Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SbsnQ8CIT9 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms