Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nup88Q8CEC0 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nup88Q8CEC0 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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