Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDG5

Crebrf, CREB3 regulatory factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrebrfQ8CDG5 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CrebrfQ8CDG5 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CrebrfQ8CDG5 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CrebrfQ8CDG5 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CrebrfQ8CDG5 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CrebrfQ8CDG5 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CrebrfQ8CDG5 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CrebrfQ8CDG5 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CrebrfQ8CDG5 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CrebrfQ8CDG5 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CrebrfQ8CDG5 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CrebrfQ8CDG5 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CrebrfQ8CDG5 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CrebrfQ8CDG5 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CrebrfQ8CDG5 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CrebrfQ8CDG5 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CrebrfQ8CDG5 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CrebrfQ8CDG5 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CrebrfQ8CDG5 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CrebrfQ8CDG5 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CrebrfQ8CDG5 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CrebrfQ8CDG5 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CrebrfQ8CDG5 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CrebrfQ8CDG5 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CrebrfQ8CDG5 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CrebrfQ8CDG5 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CrebrfQ8CDG5 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CrebrfQ8CDG5 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CrebrfQ8CDG5 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CrebrfQ8CDG5 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CrebrfQ8CDG5 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CrebrfQ8CDG5 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CrebrfQ8CDG5 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrebrfQ8CDG5 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrebrfQ8CDG5 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrebrfQ8CDG5 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrebrfQ8CDG5 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrebrfQ8CDG5 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrebrfQ8CDG5 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrebrfQ8CDG5 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrebrfQ8CDG5 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrebrfQ8CDG5 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrebrfQ8CDG5 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrebrfQ8CDG5 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrebrfQ8CDG5 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrebrfQ8CDG5 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrebrfQ8CDG5 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrebrfQ8CDG5 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrebrfQ8CDG5 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrebrfQ8CDG5 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrebrfQ8CDG5 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CrebrfQ8CDG5 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrebrfQ8CDG5 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CrebrfQ8CDG5 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrebrfQ8CDG5 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrebrfQ8CDG5 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrebrfQ8CDG5 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CrebrfQ8CDG5 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrebrfQ8CDG5 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrebrfQ8CDG5 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrebrfQ8CDG5 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrebrfQ8CDG5 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrebrfQ8CDG5 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrebrfQ8CDG5 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrebrfQ8CDG5 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrebrfQ8CDG5 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrebrfQ8CDG5 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrebrfQ8CDG5 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrebrfQ8CDG5 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CrebrfQ8CDG5 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CrebrfQ8CDG5 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CrebrfQ8CDG5 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CrebrfQ8CDG5 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CrebrfQ8CDG5 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CrebrfQ8CDG5 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CrebrfQ8CDG5 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CrebrfQ8CDG5 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CrebrfQ8CDG5 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CrebrfQ8CDG5 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CrebrfQ8CDG5 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CrebrfQ8CDG5 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CrebrfQ8CDG5 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CrebrfQ8CDG5 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CrebrfQ8CDG5 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CrebrfQ8CDG5 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CrebrfQ8CDG5 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CrebrfQ8CDG5 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CrebrfQ8CDG5 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CrebrfQ8CDG5 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CrebrfQ8CDG5 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CrebrfQ8CDG5 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CrebrfQ8CDG5 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CrebrfQ8CDG5 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CrebrfQ8CDG5 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CrebrfQ8CDG5 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CrebrfQ8CDG5 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CrebrfQ8CDG5 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CrebrfQ8CDG5 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CrebrfQ8CDG5 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
CrebrfQ8CDG5 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms