Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp20Q8C6M1 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms