Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Atg16l1Q8C0J2 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Atg16l1Q8C0J2 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Atg16l1Q8C0J2 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Atg16l1Q8C0J2 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Atg16l1Q8C0J2 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Atg16l1Q8C0J2 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Atg16l1Q8C0J2 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Atg16l1Q8C0J2 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Atg16l1Q8C0J2 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Atg16l1Q8C0J2 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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