Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Usp38Q8BW70 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Usp38Q8BW70 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Usp38Q8BW70 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Usp38Q8BW70 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp38Q8BW70 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp38Q8BW70 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp38Q8BW70 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp38Q8BW70 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp38Q8BW70 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp38Q8BW70 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp38Q8BW70 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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