Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lmod1Q8BVA4 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Lmod1Q8BVA4 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lmod1Q8BVA4 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms