Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pggt1bQ8BUY9 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Pggt1bQ8BUY9 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms