Protein–RNA interactions for Protein: Q8BT07

Cep55, Centrosomal protein of 55 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep55Q8BT07 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Cep55Q8BT07 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cep55Q8BT07 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms