Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQP8

Rab11fip4, Rab11 family-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 635 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip4Q8BQP8 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab11fip4Q8BQP8 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab11fip4Q8BQP8 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rab11fip4Q8BQP8 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rab11fip4Q8BQP8 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab11fip4Q8BQP8 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab11fip4Q8BQP8 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab11fip4Q8BQP8 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab11fip4Q8BQP8 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab11fip4Q8BQP8 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab11fip4Q8BQP8 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab11fip4Q8BQP8 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab11fip4Q8BQP8 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab11fip4Q8BQP8 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab11fip4Q8BQP8 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab11fip4Q8BQP8 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab11fip4Q8BQP8 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab11fip4Q8BQP8 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab11fip4Q8BQP8 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab11fip4Q8BQP8 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab11fip4Q8BQP8 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab11fip4Q8BQP8 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab11fip4Q8BQP8 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab11fip4Q8BQP8 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab11fip4Q8BQP8 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab11fip4Q8BQP8 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab11fip4Q8BQP8 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab11fip4Q8BQP8 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab11fip4Q8BQP8 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab11fip4Q8BQP8 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab11fip4Q8BQP8 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab11fip4Q8BQP8 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab11fip4Q8BQP8 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab11fip4Q8BQP8 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab11fip4Q8BQP8 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab11fip4Q8BQP8 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rab11fip4Q8BQP8 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab11fip4Q8BQP8 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab11fip4Q8BQP8 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab11fip4Q8BQP8 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab11fip4Q8BQP8 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab11fip4Q8BQP8 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab11fip4Q8BQP8 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab11fip4Q8BQP8 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab11fip4Q8BQP8 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab11fip4Q8BQP8 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab11fip4Q8BQP8 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab11fip4Q8BQP8 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab11fip4Q8BQP8 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab11fip4Q8BQP8 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab11fip4Q8BQP8 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab11fip4Q8BQP8 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rab11fip4Q8BQP8 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.1 ms