Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIF2

Rbfox3, RNA binding protein fox-1 homolog 3, mousemouse

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbfox3Q8BIF2 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbfox3Q8BIF2 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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