Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Htatsf1Q8BGC0 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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