Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Dsg1cQ7TSF0 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms