Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAR7

Ssxb10, MCG68110, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb10Q6XAR7 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
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Ssxb10Q6XAR7 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Ssxb10Q6XAR7 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssxb10Q6XAR7 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssxb10Q6XAR7 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ssxb10Q6XAR7 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Ssxb10Q6XAR7 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb10Q6XAR7 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb10Q6XAR7 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Ssxb10Q6XAR7 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb10Q6XAR7 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb10Q6XAR7 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb10Q6XAR7 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ssxb10Q6XAR7 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Ssxb10Q6XAR7 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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