Protein–RNA interactions for Protein: Q6BCL1

Pram1, PML-RARA-regulated adapter molecule 1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pram1Q6BCL1 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pram1Q6BCL1 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pram1Q6BCL1 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pram1Q6BCL1 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pram1Q6BCL1 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pram1Q6BCL1 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pram1Q6BCL1 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pram1Q6BCL1 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pram1Q6BCL1 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pram1Q6BCL1 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pram1Q6BCL1 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pram1Q6BCL1 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pram1Q6BCL1 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Pram1Q6BCL1 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pram1Q6BCL1 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pram1Q6BCL1 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pram1Q6BCL1 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pram1Q6BCL1 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pram1Q6BCL1 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Pram1Q6BCL1 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Pram1Q6BCL1 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Pram1Q6BCL1 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Pram1Q6BCL1 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Pram1Q6BCL1 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pram1Q6BCL1 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pram1Q6BCL1 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pram1Q6BCL1 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pram1Q6BCL1 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pram1Q6BCL1 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pram1Q6BCL1 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pram1Q6BCL1 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pram1Q6BCL1 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pram1Q6BCL1 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pram1Q6BCL1 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pram1Q6BCL1 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pram1Q6BCL1 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pram1Q6BCL1 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pram1Q6BCL1 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pram1Q6BCL1 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pram1Q6BCL1 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pram1Q6BCL1 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pram1Q6BCL1 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pram1Q6BCL1 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pram1Q6BCL1 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pram1Q6BCL1 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pram1Q6BCL1 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pram1Q6BCL1 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pram1Q6BCL1 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pram1Q6BCL1 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pram1Q6BCL1 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Pram1Q6BCL1 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Pram1Q6BCL1 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pram1Q6BCL1 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pram1Q6BCL1 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pram1Q6BCL1 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pram1Q6BCL1 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pram1Q6BCL1 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pram1Q6BCL1 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pram1Q6BCL1 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Pram1Q6BCL1 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pram1Q6BCL1 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pram1Q6BCL1 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pram1Q6BCL1 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pram1Q6BCL1 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pram1Q6BCL1 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pram1Q6BCL1 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pram1Q6BCL1 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pram1Q6BCL1 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pram1Q6BCL1 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pram1Q6BCL1 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pram1Q6BCL1 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pram1Q6BCL1 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Pram1Q6BCL1 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pram1Q6BCL1 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pram1Q6BCL1 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pram1Q6BCL1 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pram1Q6BCL1 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pram1Q6BCL1 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pram1Q6BCL1 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pram1Q6BCL1 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pram1Q6BCL1 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pram1Q6BCL1 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pram1Q6BCL1 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pram1Q6BCL1 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Pram1Q6BCL1 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Pram1Q6BCL1 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Pram1Q6BCL1 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pram1Q6BCL1 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pram1Q6BCL1 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pram1Q6BCL1 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pram1Q6BCL1 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Pram1Q6BCL1 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pram1Q6BCL1 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pram1Q6BCL1 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pram1Q6BCL1 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pram1Q6BCL1 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pram1Q6BCL1 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pram1Q6BCL1 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pram1Q6BCL1 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pram1Q6BCL1 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms