Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Irf4Q64287 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Irf4Q64287 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Irf4Q64287 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Irf4Q64287 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Irf4Q64287 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Irf4Q64287 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms