Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Taf6Q62311 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Taf6Q62311 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Taf6Q62311 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Taf6Q62311 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Taf6Q62311 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Taf6Q62311 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Taf6Q62311 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Taf6Q62311 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Taf6Q62311 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms