Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kdm5dQ62240 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Kdm5dQ62240 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kdm5dQ62240 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Kdm5dQ62240 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kdm5dQ62240 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kdm5dQ62240 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kdm5dQ62240 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kdm5dQ62240 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kdm5dQ62240 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Kdm5dQ62240 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Kdm5dQ62240 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Kdm5dQ62240 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kdm5dQ62240 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kdm5dQ62240 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kdm5dQ62240 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kdm5dQ62240 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kdm5dQ62240 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kdm5dQ62240 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kdm5dQ62240 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Kdm5dQ62240 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kdm5dQ62240 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kdm5dQ62240 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kdm5dQ62240 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Kdm5dQ62240 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Kdm5dQ62240 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kdm5dQ62240 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kdm5dQ62240 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Kdm5dQ62240 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Kdm5dQ62240 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kdm5dQ62240 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Kdm5dQ62240 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kdm5dQ62240 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kdm5dQ62240 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Kdm5dQ62240 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kdm5dQ62240 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kdm5dQ62240 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kdm5dQ62240 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kdm5dQ62240 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kdm5dQ62240 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kdm5dQ62240 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kdm5dQ62240 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kdm5dQ62240 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Kdm5dQ62240 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kdm5dQ62240 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kdm5dQ62240 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kdm5dQ62240 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kdm5dQ62240 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Kdm5dQ62240 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kdm5dQ62240 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kdm5dQ62240 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kdm5dQ62240 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kdm5dQ62240 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kdm5dQ62240 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kdm5dQ62240 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kdm5dQ62240 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kdm5dQ62240 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Kdm5dQ62240 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Kdm5dQ62240 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kdm5dQ62240 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Kdm5dQ62240 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kdm5dQ62240 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kdm5dQ62240 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kdm5dQ62240 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kdm5dQ62240 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kdm5dQ62240 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kdm5dQ62240 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Kdm5dQ62240 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Kdm5dQ62240 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Kdm5dQ62240 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kdm5dQ62240 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms