Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Gm17872-201ENSMUST00000222550 532 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Gm14913-201ENSMUST00000120011 1093 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itga6Q61739 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms