Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Csnk2a1Q60737 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms