Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Samhd1Q60710 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Samhd1Q60710 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Samhd1Q60710 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Samhd1Q60710 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Samhd1Q60710 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Samhd1Q60710 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Samhd1Q60710 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Samhd1Q60710 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Samhd1Q60710 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Samhd1Q60710 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Samhd1Q60710 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Samhd1Q60710 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Samhd1Q60710 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Samhd1Q60710 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Samhd1Q60710 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Samhd1Q60710 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Samhd1Q60710 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Samhd1Q60710 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Samhd1Q60710 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Samhd1Q60710 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Samhd1Q60710 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Samhd1Q60710 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Samhd1Q60710 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Samhd1Q60710 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Samhd1Q60710 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Samhd1Q60710 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Samhd1Q60710 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Samhd1Q60710 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Samhd1Q60710 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Samhd1Q60710 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Samhd1Q60710 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Samhd1Q60710 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Samhd1Q60710 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Samhd1Q60710 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Samhd1Q60710 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Samhd1Q60710 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Samhd1Q60710 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Samhd1Q60710 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Samhd1Q60710 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Samhd1Q60710 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Samhd1Q60710 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Samhd1Q60710 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Samhd1Q60710 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Samhd1Q60710 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Samhd1Q60710 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Samhd1Q60710 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Samhd1Q60710 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Samhd1Q60710 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Samhd1Q60710 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Samhd1Q60710 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Samhd1Q60710 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Samhd1Q60710 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Samhd1Q60710 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Samhd1Q60710 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Samhd1Q60710 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Samhd1Q60710 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Samhd1Q60710 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Samhd1Q60710 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Samhd1Q60710 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Samhd1Q60710 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Samhd1Q60710 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Samhd1Q60710 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Samhd1Q60710 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Samhd1Q60710 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Samhd1Q60710 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Samhd1Q60710 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Samhd1Q60710 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Samhd1Q60710 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Samhd1Q60710 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms