Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prdm1Q60636 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prdm1Q60636 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms