Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPW0

Vps54, Vacuolar protein sorting-associated protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps54Q5SPW0 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vps54Q5SPW0 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vps54Q5SPW0 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vps54Q5SPW0 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vps54Q5SPW0 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vps54Q5SPW0 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vps54Q5SPW0 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vps54Q5SPW0 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vps54Q5SPW0 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vps54Q5SPW0 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vps54Q5SPW0 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vps54Q5SPW0 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vps54Q5SPW0 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps54Q5SPW0 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps54Q5SPW0 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps54Q5SPW0 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps54Q5SPW0 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps54Q5SPW0 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps54Q5SPW0 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps54Q5SPW0 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps54Q5SPW0 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps54Q5SPW0 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps54Q5SPW0 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps54Q5SPW0 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps54Q5SPW0 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps54Q5SPW0 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps54Q5SPW0 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps54Q5SPW0 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps54Q5SPW0 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps54Q5SPW0 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps54Q5SPW0 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps54Q5SPW0 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps54Q5SPW0 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps54Q5SPW0 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps54Q5SPW0 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps54Q5SPW0 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps54Q5SPW0 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps54Q5SPW0 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps54Q5SPW0 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps54Q5SPW0 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps54Q5SPW0 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps54Q5SPW0 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps54Q5SPW0 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps54Q5SPW0 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps54Q5SPW0 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps54Q5SPW0 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps54Q5SPW0 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps54Q5SPW0 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps54Q5SPW0 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps54Q5SPW0 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps54Q5SPW0 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps54Q5SPW0 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps54Q5SPW0 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps54Q5SPW0 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps54Q5SPW0 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps54Q5SPW0 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps54Q5SPW0 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps54Q5SPW0 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps54Q5SPW0 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps54Q5SPW0 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps54Q5SPW0 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps54Q5SPW0 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps54Q5SPW0 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps54Q5SPW0 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps54Q5SPW0 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps54Q5SPW0 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps54Q5SPW0 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps54Q5SPW0 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps54Q5SPW0 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps54Q5SPW0 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps54Q5SPW0 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps54Q5SPW0 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps54Q5SPW0 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps54Q5SPW0 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps54Q5SPW0 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps54Q5SPW0 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps54Q5SPW0 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps54Q5SPW0 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps54Q5SPW0 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps54Q5SPW0 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps54Q5SPW0 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps54Q5SPW0 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps54Q5SPW0 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps54Q5SPW0 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps54Q5SPW0 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps54Q5SPW0 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps54Q5SPW0 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps54Q5SPW0 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps54Q5SPW0 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps54Q5SPW0 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps54Q5SPW0 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps54Q5SPW0 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps54Q5SPW0 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps54Q5SPW0 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps54Q5SPW0 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps54Q5SPW0 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps54Q5SPW0 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps54Q5SPW0 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps54Q5SPW0 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps54Q5SPW0 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms