Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Kdm5aQ3UXZ9 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Kdm5aQ3UXZ9 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Kdm5aQ3UXZ9 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Kdm5aQ3UXZ9 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Kdm5aQ3UXZ9 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Kdm5aQ3UXZ9 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Kdm5aQ3UXZ9 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Kdm5aQ3UXZ9 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Kdm5aQ3UXZ9 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Kdm5aQ3UXZ9 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Kdm5aQ3UXZ9 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Kdm5aQ3UXZ9 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Kdm5aQ3UXZ9 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kdm5aQ3UXZ9 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kdm5aQ3UXZ9 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kdm5aQ3UXZ9 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kdm5aQ3UXZ9 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kdm5aQ3UXZ9 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kdm5aQ3UXZ9 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kdm5aQ3UXZ9 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kdm5aQ3UXZ9 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kdm5aQ3UXZ9 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kdm5aQ3UXZ9 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kdm5aQ3UXZ9 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kdm5aQ3UXZ9 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kdm5aQ3UXZ9 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Kdm5aQ3UXZ9 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kdm5aQ3UXZ9 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kdm5aQ3UXZ9 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kdm5aQ3UXZ9 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kdm5aQ3UXZ9 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kdm5aQ3UXZ9 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kdm5aQ3UXZ9 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kdm5aQ3UXZ9 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kdm5aQ3UXZ9 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kdm5aQ3UXZ9 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kdm5aQ3UXZ9 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Kdm5aQ3UXZ9 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kdm5aQ3UXZ9 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Kdm5aQ3UXZ9 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kdm5aQ3UXZ9 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Kdm5aQ3UXZ9 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Kdm5aQ3UXZ9 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Kdm5aQ3UXZ9 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kdm5aQ3UXZ9 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kdm5aQ3UXZ9 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kdm5aQ3UXZ9 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kdm5aQ3UXZ9 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kdm5aQ3UXZ9 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kdm5aQ3UXZ9 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kdm5aQ3UXZ9 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kdm5aQ3UXZ9 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Kdm5aQ3UXZ9 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Kdm5aQ3UXZ9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kdm5aQ3UXZ9 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kdm5aQ3UXZ9 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kdm5aQ3UXZ9 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kdm5aQ3UXZ9 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kdm5aQ3UXZ9 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kdm5aQ3UXZ9 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kdm5aQ3UXZ9 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kdm5aQ3UXZ9 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms