Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPC7

Uncharacterized protein KIAA0825 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UPC7 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3UPC7 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3UPC7 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3UPC7 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3UPC7 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3UPC7 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3UPC7 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3UPC7 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3UPC7 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3UPC7 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3UPC7 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3UPC7 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3UPC7 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3UPC7 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3UPC7 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3UPC7 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3UPC7 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3UPC7 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3UPC7 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3UPC7 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3UPC7 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3UPC7 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3UPC7 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3UPC7 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3UPC7 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3UPC7 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3UPC7 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3UPC7 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3UPC7 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3UPC7 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3UPC7 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3UPC7 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3UPC7 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3UPC7 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3UPC7 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3UPC7 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3UPC7 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3UPC7 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3UPC7 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3UPC7 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3UPC7 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3UPC7 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3UPC7 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3UPC7 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3UPC7 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3UPC7 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3UPC7 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3UPC7 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3UPC7 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3UPC7 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3UPC7 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3UPC7 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3UPC7 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3UPC7 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3UPC7 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3UPC7 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3UPC7 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3UPC7 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3UPC7 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3UPC7 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3UPC7 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3UPC7 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3UPC7 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3UPC7 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3UPC7 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3UPC7 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3UPC7 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3UPC7 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3UPC7 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3UPC7 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3UPC7 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3UPC7 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3UPC7 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3UPC7 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3UPC7 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3UPC7 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3UPC7 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3UPC7 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q3UPC7 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q3UPC7 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3UPC7 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3UPC7 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3UPC7 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3UPC7 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3UPC7 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3UPC7 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3UPC7 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3UPC7 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3UPC7 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3UPC7 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3UPC7 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3UPC7 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3UPC7 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3UPC7 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3UPC7 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3UPC7 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3UPC7 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3UPC7 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3UPC7 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3UPC7 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms