Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Tmem253Q3UNB8 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms