Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ22

Gm648, Gene model 648, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm648Q3UJ22 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm648Q3UJ22 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm648Q3UJ22 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm648Q3UJ22 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm648Q3UJ22 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm648Q3UJ22 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm648Q3UJ22 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm648Q3UJ22 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm648Q3UJ22 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm648Q3UJ22 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm648Q3UJ22 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm648Q3UJ22 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm648Q3UJ22 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm648Q3UJ22 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm648Q3UJ22 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm648Q3UJ22 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm648Q3UJ22 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm648Q3UJ22 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm648Q3UJ22 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
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Gm648Q3UJ22 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm648Q3UJ22 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm648Q3UJ22 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm648Q3UJ22 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm648Q3UJ22 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm648Q3UJ22 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm648Q3UJ22 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm648Q3UJ22 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm648Q3UJ22 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm648Q3UJ22 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm648Q3UJ22 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm648Q3UJ22 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm648Q3UJ22 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm648Q3UJ22 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm648Q3UJ22 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm648Q3UJ22 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm648Q3UJ22 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm648Q3UJ22 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm648Q3UJ22 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm648Q3UJ22 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm648Q3UJ22 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm648Q3UJ22 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm648Q3UJ22 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm648Q3UJ22 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm648Q3UJ22 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
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Gm648Q3UJ22 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm648Q3UJ22 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm648Q3UJ22 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm648Q3UJ22 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm648Q3UJ22 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm648Q3UJ22 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm648Q3UJ22 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm648Q3UJ22 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm648Q3UJ22 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Gm648Q3UJ22 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm648Q3UJ22 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm648Q3UJ22 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm648Q3UJ22 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm648Q3UJ22 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm648Q3UJ22 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm648Q3UJ22 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm648Q3UJ22 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
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Gm648Q3UJ22 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm648Q3UJ22 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm648Q3UJ22 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm648Q3UJ22 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm648Q3UJ22 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm648Q3UJ22 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm648Q3UJ22 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm648Q3UJ22 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm648Q3UJ22 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm648Q3UJ22 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm648Q3UJ22 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm648Q3UJ22 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm648Q3UJ22 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm648Q3UJ22 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm648Q3UJ22 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm648Q3UJ22 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm648Q3UJ22 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm648Q3UJ22 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm648Q3UJ22 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm648Q3UJ22 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm648Q3UJ22 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm648Q3UJ22 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm648Q3UJ22 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm648Q3UJ22 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm648Q3UJ22 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm648Q3UJ22 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm648Q3UJ22 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm648Q3UJ22 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm648Q3UJ22 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm648Q3UJ22 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm648Q3UJ22 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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