Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ssbp4Q3U4B1 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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