Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Ulk3Q3U3Q1 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Ulk3Q3U3Q1 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms