Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hace1Q3U0D9 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hace1Q3U0D9 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms