Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ctdnep1Q3TP92 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ctdnep1Q3TP92 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
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