Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c3Q3TMP1 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms