Protein–RNA interactions for Protein: Q1RME4

Gm1123, CAR-like soluble protein, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1123Q1RME4 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm1123Q1RME4 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm1123Q1RME4 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm1123Q1RME4 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm1123Q1RME4 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm1123Q1RME4 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm1123Q1RME4 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm1123Q1RME4 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm1123Q1RME4 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm1123Q1RME4 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm1123Q1RME4 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm1123Q1RME4 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm1123Q1RME4 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm1123Q1RME4 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm1123Q1RME4 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm1123Q1RME4 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm1123Q1RME4 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm1123Q1RME4 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm1123Q1RME4 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm1123Q1RME4 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm1123Q1RME4 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm1123Q1RME4 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm1123Q1RME4 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm1123Q1RME4 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm1123Q1RME4 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm1123Q1RME4 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm1123Q1RME4 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm1123Q1RME4 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm1123Q1RME4 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm1123Q1RME4 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm1123Q1RME4 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm1123Q1RME4 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm1123Q1RME4 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm1123Q1RME4 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm1123Q1RME4 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm1123Q1RME4 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm1123Q1RME4 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm1123Q1RME4 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm1123Q1RME4 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm1123Q1RME4 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm1123Q1RME4 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm1123Q1RME4 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm1123Q1RME4 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm1123Q1RME4 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm1123Q1RME4 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm1123Q1RME4 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm1123Q1RME4 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm1123Q1RME4 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm1123Q1RME4 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm1123Q1RME4 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm1123Q1RME4 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm1123Q1RME4 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm1123Q1RME4 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm1123Q1RME4 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm1123Q1RME4 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm1123Q1RME4 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm1123Q1RME4 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm1123Q1RME4 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm1123Q1RME4 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm1123Q1RME4 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm1123Q1RME4 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm1123Q1RME4 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm1123Q1RME4 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm1123Q1RME4 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm1123Q1RME4 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm1123Q1RME4 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm1123Q1RME4 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Gm1123Q1RME4 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm1123Q1RME4 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm1123Q1RME4 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm1123Q1RME4 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm1123Q1RME4 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm1123Q1RME4 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm1123Q1RME4 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm1123Q1RME4 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm1123Q1RME4 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm1123Q1RME4 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm1123Q1RME4 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm1123Q1RME4 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm1123Q1RME4 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm1123Q1RME4 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm1123Q1RME4 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm1123Q1RME4 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm1123Q1RME4 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm1123Q1RME4 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm1123Q1RME4 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm1123Q1RME4 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm1123Q1RME4 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm1123Q1RME4 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm1123Q1RME4 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm1123Q1RME4 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm1123Q1RME4 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm1123Q1RME4 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm1123Q1RME4 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm1123Q1RME4 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm1123Q1RME4 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm1123Q1RME4 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms